Het dagelijks bestuur van het Nationaal Programma Rotterdam Zuid is samengesteld uit vertegenwoordigers van de verschillende partners. Het huidige dagelijks bestuur bestaat uit:
Ahmed Aboutaleb, burgemeester van Rotterdam,
onafhankelijk voorzitter
Bilal Saidi, lid wijkraad Hillesluis
namens de bewoners
Diane Middelkoop, voorzitter college van bestuur PCBO Rotterdam Zuid
namens de onderwijspartners
Fred Westerbeke, politiechef Eenheid Rotterdam
Hugo Hillenaar, hoofdofficier van Justitie Rotterdam
namens veiligheidspartners (Politie, OM, Reclassering Nederland)
Dick van Well, voormalig voorzitter Raad van Bestuur Dura Vermeer, voormalig voorzitter Feyenoord
namens de werkgevers
Victor van der Chijs, voorzitter Deltalinqs
namens de werkgevers
Tim Versnel, wethouder Werk&Inkomen, NPRZ, EU-arbeidsmigranten
namens de gemeente Rotterdam
Wietske Vrijland, lid Raad van Bestuur Maasstad Ziekenhuis
namens de zorg
Hedy van den Berk, bestuursvoorzitter Havensteder
namens de woningcorporaties
Chris Kuijpers, Directeur-Generaal Bestuur, Ruimte en Wonen, ministerie van BZK
namens het Rijk
De bestuurszetel voor cultuur is vacant.
Naast de bestuursleden heeft het NPRZ ook mensen die een ambassadeursschap vervullen bij het NRPZ:
Hans Rijnierse
NPRZ Governancepaper
Op verzoek van het NPRZ-bestuur heeft Van de Bunt Adviseurs een paper geschreven waarin de governance van het NPRZ-bestuur wordt beschreven. Deze paper is vervolgens door het NPRZ-bestuur vastgesteld. De laatste wijziging heeft plaatsgevonden in 2019. De zittingstermijn van de bestuurders is toen toegevoegd.